[ROSALIND] 단백질 서열로 번역하기

문제 (풀어보기)

RNA 서열이 주어졌을 때 단백질 서열로 번역하시오.
다만, RNA 서열은 항상 AUG로 시작하고 stop codon으로 끝나기 때문에 3 frame을 고려할 필요는 없다.

예시

AUGGCCAUGGCGCCCAGAACUGAGAUCAAUAGUACCCGUAUUAACGGGUGA

예상 결과

MAMAPRTEINSTRING

 

해결

codon = {}
with open("aa_codon.txt", "r") as f:
    for line in f.readlines():
        aa = line.split()
        for i in range(0, len(aa), 2):
            codon[aa[i]] = aa[i+1]

def translation(rna):
    protein = ''
    for i in range(0, len(rna), 3):
        protein += codon[rna[i:i+3]]
    
    return protein.replace('Stop', '')

 

RNA 번역에 필요한 codon 정보이다.

UUU F      CUU L      AUU I      GUU V
UUC F      CUC L      AUC I      GUC V
UUA L      CUA L      AUA I      GUA V
UUG L      CUG L      AUG M      GUG V
UCU S      CCU P      ACU T      GCU A
UCC S      CCC P      ACC T      GCC A
UCA S      CCA P      ACA T      GCA A
UCG S      CCG P      ACG T      GCG A
UAU Y      CAU H      AAU N      GAU D
UAC Y      CAC H      AAC N      GAC D
UAA Stop   CAA Q      AAA K      GAA E
UAG Stop   CAG Q      AAG K      GAG E
UGU C      CGU R      AGU S      GGU G
UGC C      CGC R      AGC S      GGC G
UGA Stop   CGA R      AGA R      GGA G
UGG W      CGG R      AGG R      GGG G

aa_codon.txt

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